乃琼寺，位于西藏拉萨市的哲蚌寺的旁边。藏语中“乃”即“地方”意思，而“琼”是“小”的意思，乃琼寺意思就是哲蚌寺下的一个“小地方”，一个小的不需要人们注意。但这乃琼寺却是历史上西藏著名的佛教高等学府，每年考中格西学位的喇嘛多出于此，是著名的佛学院。凡是考上格西的喇嘛，在西藏就有可能担任三大寺的住持，极其优秀的甚至可以任甘丹寺法台，最少也可以担任其它格鲁派寺院的主持，这在西藏对于僧人来说是最高的荣誉了。但考格西学位不是那么容易的，僧人们需要经过二三十年的学习，然后再经过层层严格的考核，才有资格申请。

大殿及四廊的壁画色彩浓重辉煌，和其他寺庙不同，极具观赏价值，内容几乎都跟护法和降魔，地狱与苦难相关。据传在公元八世纪莲花大师将凶恶的乃琼多吉札丹降伏，其成为了法力无边的乃琼神汉，这是西藏最神奇的一种巫师。同时也保存下来一种降神的宗教仪式。